裕固族分别使用三种语言：东部裕固语、西部裕固语和汉语。
　　西部裕固语亦称“尧乎尔语”，属于阿尔泰语系突厥语族东匈语支。一些学者认为，西部裕固语属于保存古代突厥语特泰点较多的上古突厥语，并指出它是回鹘文献语言的“嫡语”。使用这种语言的有亚拉格家、贺郎格家、西八个家三个部落，主要分布在肃南裕固族自治县西部，即今天的明花区的莲花乡、明海乡，大河区的韭菜沟乡和皇城区的马营乡等地。

　　东部裕固族亦称“恩格尔语”，属于阿尔泰语东乡蒙古语族。据研究，它接近于十三世纪的蒙古语，保留较多的古代蒙古语词汇和语音的特点。使用东部裕固语的有大头目家、罗儿家、杨哥家、东八个家、四个马家五个部落，主要分布在自治县东部康乐区的康乐乡、红石窝乡、青龙乡，大河区的红星乡，以及皇城区的北峰乡、北极乡、东滩乡等。
　　使用汉语的主要是居住在明花区前滩和酒泉县黄泥堡等地的裕固族。操不同语言的裕固族人们，相互人们也以汉语作为共同的交际工具。另外，无论是西部裕固语或是东部裕固语，都吸收了大量的汉语借词，涉及的范围还相当广泛。另据调查，大河区、皇城区有一部分人兼通两种裕固语。此外，皇城区有少数人会说藏语。
　　裕固族先民曾经使用过古代回鹘文，后来，他们失去了自己的文字。现在，他们没有本民族的文字，通用汉文。